Sequenzierung - SMRT (Single Molecule Real Time) - DNA Sequezer von Pacific Biosciences

Lexikon


Neuartiges Sequenziergerät, das einzelne DNA-Moleküle während der Replikation durch die DNA-Polymerase sequenziert, ohne diese vorher durch einen PCR-Schritt zu amplifizieren. 

Die Single-Molecule Real-Time (SMRT) Sequencing Methode basiert auf einem natürlichen Prozess, der bei jeder Zellteilung stattfindet. Vor jeder Teilung replizieren die DNA-Polymerasen die DNA. Im Zuge der Sequenzierung wird jedes der vier Nukleotide zunächst mit einem fluoreszierenden Phosphat-Farbstoff versehen, der von der DNA-Polymerase beim Einbau des Nukleotids in den komplementären DNA-Strang abgetrennt wird. Das Signal eines jeden neu eingebauten Nukleotids wird erfasst und korrespondiert mit der entstehenden DNA-Sequenz. Die DNA-Polymerase kann komplementäre DNA-Stränge über weite Strecken mit großer Genauigkeit in Echtzeit anfertigen, also während die DNA-Polymerase den Einzelstrang komplementiert.

Ein Video zum Sequenzierschema finden Sie hier.
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