Paired end reads sind eine Sequenzierungsstrategie, bei der zwei verschiedene Regionen, die räumlich getrennt voneinander aber auf einem DNA-Abschnitt liegen, abgelesen werden.
Dieses Verfahren führt zu einer erhöhten physikalischen Abdeckung und verringert die Einschränkungen von Next-Generation-Sequenzierungsplattformen, die auf deren kurze Leselängen zurückzuführen sind.